流式實驗中的抗體滴定

一般我們購買商品化的primary antibody的時候，抗體的說明書中都會給我們一個推薦的抗體使用濃度。這個濃度在一定程度上來說，是過飽和的，可以滿足大多數實驗的染色需求。

但是因為是過飽和的濃度，這就帶來了一定程度的抗體浪費。而過量的抗體，也會大大提高樣本的自發熒光。

從另一個角度來看，因為廠家給出的推薦濃度都是基于一個特定的樣本濃度和樣本體積，所以在一些特殊的實驗中，比如樣本濃度或樣本體積過大的實驗，推薦的濃度就無法達到飽和滴加的要求。在這樣的前提下，推薦實驗用戶針對自己的實驗要求，zui好可以對抗體進行滴定。節約成本的同時，也可以讓自己的實驗更加。

滴定的原則：

1. 在進行滴定實驗前，應該遵守一個實驗一個變量的原則。既然滴定實驗要求的是摸索出準確的抗體工作濃度，那在制作樣本前，也需要對其他的實驗條件進行統一。而這些在滴定實驗中的條件，也應該沿用到后續的正式實驗中去。

2. 需要統一的條件：樣本，樣本數量/管，樣本體積/管，孵育條件等。總的來說，一個成功的滴定實驗，只應該有“抗體的終濃度不同”這一個實驗中的變量。

3. 滴定的稀釋倍數：一般按照5倍稀釋的標準做5個梯度的原則做滴定實驗。也可根據自己的實驗進行適當調整。起點濃度的選擇則需要按照具體的實驗進行分析。比如，對于PBMC或者裂解后的全血、脾臟之類的樣本，活細胞比例高，單管樣本一般以1*10^6為上限。可以從推薦用量開始，往下5倍稀釋，做5個梯度。但是有些原代細胞，比如涉及腫瘤免疫方面的樣本，活細胞比例低，免疫細胞的浸潤比例低，所以制備的樣本數量也會比較大，這個時候，也可以選擇超過推薦的濃度滴加，然后再進行梯度稀釋。

4. 滴定實驗完成后，通過計算染色指數（stain Index）確定zui佳抗體濃度。染色指數公式如下：

示例：

我們以anti-human CD3抗體舉例：在100ul全血樣本中，我們以該抗體推薦的用量5ul/tube 為高濃度，5倍稀釋，并設置5個梯度。高濃度至低濃度分別是5ul/100ul blood，1ul/100ul blood，0.2ul/100ul blood，0.04ul/100ul blood，0.008ul/100ul blood。通過計算，染色指數由高濃度到低分別為98.57，106.29，96.97，12.36，8.58。從染色指數上看，我們挑選出zui優的抗體濃度為1ul/100ul blood。即為推薦用量的1/5。

用第三方軟件進行數據疊加可以一目了然。

注意事項：

1. 對于一些陽性表達幾乎100%的細胞，比如PBMC中的CD45,可以在樣本染色后少量加入未染色的細胞。

2. 對于表達量比較少的稀有細胞群體，在染色時，可加入該群細胞的父級細胞群的抗體。在設計多色實驗的滴定時，zui好可以分批滴定。將表達量高的抗體先進行滴定。確定zui佳濃度后，再滴定表達量少的抗體，并將已經滴定好的抗體一同加入。比如我們在滴定外周血中的foxp3時，zui好可以加入已經確定好濃度的CD4抗體。

3. 對于消化的組織來說，因為存在大量的死細胞，所以在這些樣本的滴定過程中，要先加入死活染料區分死活，再確定目標抗體的濃度。

4. 是否需要在滴定前blocking？取決于正式實驗。如果正式實驗是封閉的，那么滴定實驗也需要。

5. 遇到不同廠家，不同貨號，不同克隆號的抗體，需要重新滴定。

6. 滴定完成后，理論上只要cat號一致，lot號不一致，不需要重新滴定。但是為了保險起見，每一瓶抗體，特別是不同lot的抗體，zui好留一個樣本的抗體量，以方便日后的QC或者實驗復盤。